发酵研发团队负责寻找那些最能提升产量的菌株、培养基配方、喂养策略以及工艺条件。借助人工智能驱动的设计方法,可以生成数百种候选实验方案,从而加快这一寻找过程——但这些预测结果仍需通过实验来验证。
问题恰恰出在这一点上:虽然 HPLC 仍是样品确认的必要手段,但每个样品的检测时间往往需要数十分钟;而拉曼光谱技术则能在几秒钟内完成检测。在处理大量样品时,这种速度上的差异足以改变工作流程——数百个样品可以通过拉曼光谱在不到一小时内完成筛选,而同样的样品组若用 HPLC 分析则可能需要数天时间。
团队无需将所有发酵样本都直接送入色谱仪进行分析,而是可以使用 PoliSpectra® Rapid Raman Plate Reader(RPR)快速筛选大量样本,找出最具潜力的候选样本,进而确定哪些样本确实需要通过 HPLC 进行进一步验证。由于拉曼分析属于非破坏性检测方法,在通过拉曼分析掌握整体的化学特征后,这些样本仍可再用 HPLC 进行分析以获得最终确认结果。
通过将拉曼光谱技术应用于高通量板式检测仪中,RPR 能够以 24 孔、96 孔或 384 孔格式实现快速筛选。科研团队可以迅速评估关键的代谢参数、识别化学变化趋势、发现异常值,并确定那些最有可能带来更高产量或显著工艺差异的样本。
这样一来,发酵研发流程的扩展性便得到了提升:人工智能可预测更多实验条件,RPR 用于快速筛选大量实验样本,而 HPLC 则用于确认其中最具有价值的候选方案。
上图概述了整个工作流程:首先建立基于拉曼光谱的滴定模型,并通过 HPLC 对其进行验证,之后利用已验证的模型快速筛选大量的发酵样本,只有最关键的样本才会被送入 HPLC 进行进一步确认。
为说明这一工作流程,此处选取的示例以葡萄糖这一关键的发酵底物为例。同样的方法也可应用于其他发酵代谢物,某些情况下甚至可用于最终产物。
RPR 采用 785 nm 的拉曼激发光,对五种不同培养基中的葡萄糖滴定样本进行了检测,共计 45 个样本,涵盖了多种不同的葡萄糖浓度。这些测量数据被用于构建基于拉曼技术的葡萄糖预测模型,随后该模型还通过 HPLC 进行了验证。
文末展示的实测数据反映了模型构建的过程。左侧面板显示了从不同培养基中的 45 个样本中采集的拉曼光谱数据;右侧面板则将基于拉曼模型预测的葡萄糖浓度与通过 HPLC 测得的实际葡萄糖浓度进行了对比。
拉曼光谱技术能够准确测定五种培养基中的四种所含的葡萄糖浓度。不过 D 培养基的荧光背景值过高,干扰了拉曼测量的准确性,从而导致预测精度下降。对于荧光强度过高的样本,可以通过专门的校准模型进行处理,或将其标记出来以便后续通过 HPLC 进行进一步分析。
最关键的差异在于速度。使用 RPR 即可在 10 分钟内完成全部 45 个样本的检测,平均每个样本仅需约 12.5 秒,而采用 HPLC 方法则需数小时才能完成相同工作。在大多数培养基中,拉曼光谱都能准确检测出葡萄糖含量的变化趋势,这充分体现了在模型建立并得到验证之后,RPR 作为前端筛选工具的实用价值。
通过将人工智能驱动的发酵设计与高通量拉曼筛选相结合,PoliSpectra® RPR 能够帮助科研团队更快地从预测阶段进入验证阶段,从而确保 HPLC 分析及放大生产相关的资源能够集中在最能创造价值的地方。
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